無事Radiusサーバーにて認証することができました。
RadiusサーバーにMACアドレスの２桁区切りのセパレーターであるハイフンを抜いたものを登録したところ認証に成功しました。
以下configです。（ポート3,4を認証ポートとして設定）
vlan database
vlan 2
exit
interface vlan 2
dot1x guest-vlan
exit
（省略）
dot1x system-auth-control
interface range gi3-4
dot1x reauthentication
exit
interface range gi3-4
dot1x mac-authentication mac-only
exit
interface range gi3-4
dot1x guest-vlan enable
exit
interface gigabitethernet3
dot1x port-control auto
exit
interface gigabitethernet4
dot1x port-control auto
exit
radius-server host [IPアドレス] key [キー]
aaa authentication dot1x default radius
interface gigabitethernet1
switchport mode access
exit
interface gigabitethernet2
switchport mode access
exit
interface gigabitethernet3
switchport mode access
exit
interface gigabitethernet4
switchport mode access
exit
