ISR4000 シリーズルータにて NIM(Network Interface Module) を使用し Sapping Tree を 有効にする場合、spanning tree mode を設定しなければ STP が有効になりません。
Catalyst switch では default で spanning tree mode が設定されていますが、ISR4000 シリーズルータでは下記の設定を行う必要があります。
spanning-tree mode { mst | pvst | rapid-pvst }
※参考
Cisco 4000 シリーズ ISR 用 Cisco 4 ポートおよび 8 ポート レイヤ 2 ギガビット EtherSwitch ネットワーク インターフェイス モジュール設定ガイド