Olá Bruno,
Infelizmente VDC (Virtual Device Context) ainda não é suportado na linha Nexus 5000. O software NX-OS suporta multiplos VDCs, mas no caso do Nexus 5000 todos os recursos do sistema são oferecidos ao VDC 1 (default) e não há como criar outros.
Para sua informação o Nexus 7000 suporta até 4 VDCs e, neste caso, respondendo a sua pergunta, é possível segregar em instancias virtuais o uso das VLANs. Cada VDC age como um equipamento distinto (ou seja, cada VDC é totalmente isolado dos outros) e os números (ID) e nomes das VLANs podem se repetir de um VDC para outro em um mesmo Nexus 7000, o que pode até quadruplicar a quantidade de VLANs a serem usadas.
Espero ter respondido sua pergunta.
Abraço,
Pedro