Olá Daniel, tudo bem?
Como você pretende fazer esse controle de banda? se você quer fazer por policy-map, faz o match nas classes pelas subredes das VLANs, ela seria aplicada na F0/0 em sentido out e não afetaria o tráfego entre as VLANs.
Ex:
ip access-list extended VLAN_A_ACL
permit ip 10.10.10.0 0.0.0.255 any
ip access-list extended VLAN_B_ACL
permit ip 20.20.20.0 0.0.0.255 any
class-map match-all VLAN_B_CLASS
match access-group name VLAN_B_ACL
class-map match-all VLAN_A_CLASS
match access-group name VLAN_A_ACL
policy-map LIMIT_BDW
class VLAN_A_CLASS
police 1000
class VLAN_B_CLASS
police 2000
int f0/0
service-policy output LIMIT_BDW