Muy probablemente sea porque lo estas realizando sobre las interfaces fisicas y no las interface logica Port-channel, entonces intenta con:
interface portchannel X
speed <velocidad>
duplex <tipo de negociacion>
Recuerda que en ambos extremos debe estar configurado igual, mi recomendacion es que ingreses el comando shutdown, para deshabilitar temporalmente el port channel y aplicar los cambios, despues reactivarlo.
Saludos
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